Doctorat : circuits cellulaires dans les maladies respiratoires chroniques H/F (Marie Slodowska-Curie Action)

Description du sujet de thèse

Ce doctorat fait partie du réseau doctoral "RESPIRE-EXCEL".
L'asthme et la BPCO (Bronchopneumopathie chronique obstructive) sont des maladies respiratoires chroniques très répandues qui représentent un lourd fardeau social et économique. Les traitements traditionnels suivent souvent une approche "unique", se contentant de supprimer les symptômes sans apporter de véritables améliorations à la santé. Le réseau doctoral MSCA RESPIRE-EXCEL devrait révolutionner cette approche en introduisant une médecine de précision adaptée à chaque patient.

L'objectif de ce projet de doctorat est de fournir une analyse détaillée des événements cellulaires précoces dans les voies respiratoires des patients aux premiers stades de la BPCO, afin de découvrir des marqueurs précoces potentiels et des cibles thérapeutiques pour cette maladie chronique. Le projet explorera en détail notre atlas sur cellules uniques inédit obtenu à partir de biopsies des voies respiratoires de patients atteints de BPCO et cartographiera spatialement les voies dysrégulées à l'aide de la transcriptomique spatiale. L'utilisation de modèles in vitro et ex vivo permettra d'identifier les états associés à la maladie et la spécificité cellulaire des réponses à la fumée de cigarette. Le candidat au doctorat intégrera également toutes ces données avec les données longitudinales des cohortes afin de relier les mécanismes cellulaires aux données des patients. Ce projet de doctorat en médecine translationnelle offre aux candidats une occasion unique d'acquérir une expérience pratique à la fois des techniques de laboratoire et de la bioinformatique, favorisant une double expertise qui est très recherchée dans le paysage biomédical actuel.

Un séjour de 6 mois est prévu au Helmholtz Center de Munich, Allemagne, pour la partie bioinformatique.

Connaissances et compétences requises spécifiques à ce projet de doctorat :

Le candidat doit être titulaire d'une maîtrise dans les domaines de la biologie cellulaire et moléculaire, du développement, de la génomique et de la physiologie.
Un diplôme en bioinformatique n'est pas nécessaire, mais une formation et une expérience en bioinformatique seront grandement appréciées.

Les candidats doivent saisir leur dossier sur la plateforme du MSCA :
https://werkenbijumcg.nl/vacatures/solliciteren?url=https://www.tangram-tis.nl/10420/Kandidaten/Inschrijven/10419%2D02S0009EMP

Contexte de travail

Le poste est à pourvoir au sein de l'Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire à Valbonne – Sophia Antipolis (Alpes Maritimes). L'IPMC regroupe 22 équipes de recherche et des services communs pour un effectif global de plus de 250 personnes. La personne recrutée travaillera au sein de l'équipe de recherche "Génomique physiologique des Eucaryotes", dirigée par le Dr. Pascal Barbry, première équipe française à avoir été impliquée dans le consortium international Human Cell Atlas.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.